Message fourni par Yannek Käber et Maximilian Pichler Nous nous sommes rencontrés à YOMOS, un atelier destiné aux chercheurs en début de carrière et aux jeunes modélisateurs en écologie soutenu par la Société allemande pour l’écologie, et nous sommes arrivés à la modélisation par des angles opposés. Yannek construit des modèles forestiers dynamiques, qui sont des modèles mécanistes intégrant des décennies de raisonnement écologique sur la façon dont les arbres poussent, rivalisent et meurent. Max construit des modèles d’apprentissage automatique pour l’écologie qui sont flexibles, gourmands en données et corrélatifs, et donc pour la plupart indifférents […]
Article de blog fourni par Hubert A. Szczygieł Origines En 2022, j’étais au Panama pour travailler sur la surveillance de la biodiversité à l’échelle du paysage. Le système que je testais comprenait de nombreuses approches standard : par exemple des caméras de surveillance pour les mammifères, des points d’écoute et une surveillance acoustique passive pour les oiseaux, ainsi que des transects Gentry pour les arbres. Cependant, j’ai réalisé qu’aucune des méthodologies standards de surveillance des insectes ne fonctionnait pour des enquêtes systématiques à grande échelle. Je n’avais pas le temps de traiter des collections massives d’insectes, et […]
Article fourni par Karen Dyson et Kayla Aburida Lorsque nous avons commencé à utiliser l’ADN environnemental du sol (ADNe) pour comprendre comment les pratiques agricoles durables affectent la biodiversité, nous pensions que les parties les plus difficiles se trouveraient en laboratoire ou dans l’analyse. Nous avions tort. Au contraire, l’un des plus grands défis est survenu bien plus tôt : sur le terrain, lors de la collecte de données. L’ADNe du sol est inégal, façonné par les microhabitats, la couverture végétale, la microtopologie, les conditions du sol et les mouvements des organismes. Cette inégalité constitue un […]
Message fourni par Jonathan Syme Imaginez cette scène idyllique : vous êtes à bord d’un navire de recherche qui avance régulièrement à travers la vaste mer bleue, effectuant des allers-retours le long d’un ensemble de lignes de transect, sa trace étant enregistrée par un GPS. A travers vos jumelles, vous voyez une colonne d’embruns, un dos cambré, un coup de chance qui s’élève bien au-dessus de l’eau, puis disparaît. Vous criez « baleine ! » et votre collègue saisit l’observation – le lieu, l’heure, l’espèce – dans la base de données. Imaginez maintenant cette scène pas si idyllique : vous êtes […]
Article fourni par Nyniane Steinkampf–Pellecuer, Idriss Pelletan et Pauline Provini Nous sommes deux doctorants et chercheur au laboratoire MECADEV du Muséum national d’Histoire naturelle de Paris. Dans le cadre de nos recherches sur l’évolution des oiseaux, nous étudions la morphologie fonctionnelle de leurs organes pour comprendre comment leur forme est liée à leur fonction, et comment ils ont évolué. En raison de la taille du groupe que nous étudions (les oiseaux comptent plus de 11 000 espèces) et d’autres contraintes telles que la disponibilité des spécimens dans les collections, nous devons mener nos analyses sur des […]
Article fourni par Richard P. Shefferson, Université de Tokyo La projection matricielle est devenue largement utilisée par les écologistes des populations pour analyser et prédire le comportement des populations sauvages de plantes et d’animaux… et parfois même d’autres organismes plus étranges (Salguero-Gómez et coll. 2015 ; Salguero‐Gómez et coll. 2016). Au cours des dernières décennies, la taille et la complexité de ces modèles ont considérablement augmenté, les dimensions des matrices allant désormais de seulement deux lignes et colonnes à des dizaines de milliers (Shefferson 2022). Les styles matriciels ne se limitent plus aux matrices de Leslie et […]
Message fourni par Hiroshi Hakoyama. Repenser la probabilité d’extinction en tant que critère de conservation Penser la conservation en termes d’extinction d’espèces comme objectif sous-tend la manière dont les priorités sont fixées dans la Liste rouge de l’UICN et dans la CITES. À la base, ces cadres visent à décider quelles populations ou quels taxons devraient être prioritaires pour les efforts de conservation. Pourtant, l’analyse de viabilité de la population (PVA), qui vise à quantifier elle-même la probabilité d’extinction, fait depuis longtemps l’objet de débats. Une préoccupation récurrente est que, pour des séries chronologiques écologiques courtes […]
Article fourni par Natalie Cooper, rédactrice en chef de MEE Dans mon dernier article de blog J’ai écrit de manière générale sur pourquoi et comment organiser un hackathon. Pour rendre ces instructions un peu plus claires, je donne ci-dessous un exemple du hackathon de données et de code BES que nous avons organisé du 29 au 30 septembre 2025. Notez que techniquement, il s’agissait en réalité d’un datathon plutôt que d’un hackathon ! Nous avons suivi le plan présenté dans mon article précédent. Rassemblez votre équipe organisationnelle principale Tout comme Nick Fury, j’ai d’abord réuni une équipe […]
Article fourni par Natalie Cooper, rédactrice en chef de MEE En septembre 2025, nous avons organisé un hackathon pour collecter des données pour un article sur le partage de données et de codes entre les revues BES. Après l’événement, nous avons pensé qu’il serait intéressant de partager ce que nous avons appris sur les hackathons ici sur le blog MEE. Un grand merci à tous les participants du BES Data and Code Hackathon pour leur contribution ! Qu’est-ce qu’un hackathon ? Le mot « hackathon » est un mot-valise qui combine les mots « hacking » et […]
BIEN 4.2 : Une norme reproductible pour les données mondiales sur la biodiversité végétale Message fourni par le groupe de travail BIEN Pendant des centaines d’années, les biologistes ont soigneusement collecté des informations sur les plantes, les animaux et d’autres organismes et ont créé et entretenu d’énormes bibliothèques de spécimens physiques provenant du monde entier. Les spécimens sont collectés avec toutes sortes d’informations – il y a souvent un exemple physique, mais au-delà de cela, les scientifiques enregistrent où et quand l’échantillon a été collecté, par qui et quel était le nom d’espèce de cet organisme à […]
