Message fourni par Jonathan Syme Imaginez cette scène idyllique : vous êtes à bord d’un navire de recherche qui avance régulièrement à travers la vaste mer bleue, effectuant des allers-retours le long d’un ensemble de lignes de transect, sa trace étant enregistrée par un GPS. A travers vos jumelles, vous voyez une colonne d’embruns, un dos cambré, un coup de chance qui s’élève bien au-dessus de l’eau, puis disparaît. Vous criez « baleine ! » et votre collègue saisit l’observation – le lieu, l’heure, l’espèce – dans la base de données. Imaginez maintenant cette scène pas si idyllique : vous êtes […]
Article fourni par Nyniane Steinkampf–Pellecuer, Idriss Pelletan et Pauline Provini Nous sommes deux doctorants et chercheur au laboratoire MECADEV du Muséum national d’Histoire naturelle de Paris. Dans le cadre de nos recherches sur l’évolution des oiseaux, nous étudions la morphologie fonctionnelle de leurs organes pour comprendre comment leur forme est liée à leur fonction, et comment ils ont évolué. En raison de la taille du groupe que nous étudions (les oiseaux comptent plus de 11 000 espèces) et d’autres contraintes telles que la disponibilité des spécimens dans les collections, nous devons mener nos analyses sur des […]
Article fourni par Richard P. Shefferson, Université de Tokyo La projection matricielle est devenue largement utilisée par les écologistes des populations pour analyser et prédire le comportement des populations sauvages de plantes et d’animaux… et parfois même d’autres organismes plus étranges (Salguero-Gómez et coll. 2015 ; Salguero‐Gómez et coll. 2016). Au cours des dernières décennies, la taille et la complexité de ces modèles ont considérablement augmenté, les dimensions des matrices allant désormais de seulement deux lignes et colonnes à des dizaines de milliers (Shefferson 2022). Les styles matriciels ne se limitent plus aux matrices de Leslie et […]
Message fourni par Hiroshi Hakoyama. Repenser la probabilité d’extinction en tant que critère de conservation Penser la conservation en termes d’extinction d’espèces comme objectif sous-tend la manière dont les priorités sont fixées dans la Liste rouge de l’UICN et dans la CITES. À la base, ces cadres visent à décider quelles populations ou quels taxons devraient être prioritaires pour les efforts de conservation. Pourtant, l’analyse de viabilité de la population (PVA), qui vise à quantifier elle-même la probabilité d’extinction, fait depuis longtemps l’objet de débats. Une préoccupation récurrente est que, pour des séries chronologiques écologiques courtes […]
Message fourni par Xi Peng Lorsque j’ai commencé à analyser des données métagénomiques provenant de suintements froids et de sources chaudes, je ne m’attendais pas à passer autant de temps à regarder des lignes de code confuses et des séquences fragmentées. Pourtant, ces traces numériques – des fragments brisés d’ADN dispersés dans une matrice de complexité microbienne – portent les empreintes digitales de la vie dans les habitats les plus extrêmes de la Terre. Dans ce travail, nous avons développé une approche pour comprendre comment la longueur de ces lectures d’ADN affecte notre capacité à reconstruire […]
Article fourni par le Dr Aaron M. Ellison, rédacteur en chef de Methods in Ecology and Evolution Vous avez travaillé pendant des mois, parfois des années, pour développer et tester une nouvelle méthode, et avez passé autant de temps à rédiger le manuscrit. C’est enfin terminé et après avoir parcouru le système de soumission en ligne et téléchargé et vérifié vos fichiers, vous appuyez sur le bouton « soumettre mon manuscrit ». À l’époque des ténèbres (ou du moins avant l’an 2000), vous pouviez être sûr que votre manuscrit serait révisé et qu’il faudrait 2 à […]
Article fourni par Natalie Cooper, rédactrice en chef de MEE Dans mon dernier article de blog J’ai écrit de manière générale sur pourquoi et comment organiser un hackathon. Pour rendre ces instructions un peu plus claires, je donne ci-dessous un exemple du hackathon de données et de code BES que nous avons organisé du 29 au 30 septembre 2025. Notez que techniquement, il s’agissait en réalité d’un datathon plutôt que d’un hackathon ! Nous avons suivi le plan présenté dans mon article précédent. Rassemblez votre équipe organisationnelle principale Tout comme Nick Fury, j’ai d’abord réuni une équipe […]
Article fourni par Natalie Cooper, rédactrice en chef de MEE En septembre 2025, nous avons organisé un hackathon pour collecter des données pour un article sur le partage de données et de codes entre les revues BES. Après l’événement, nous avons pensé qu’il serait intéressant de partager ce que nous avons appris sur les hackathons ici sur le blog MEE. Un grand merci à tous les participants du BES Data and Code Hackathon pour leur contribution ! Qu’est-ce qu’un hackathon ? Le mot « hackathon » est un mot-valise qui combine les mots « hacking » et […]
Article fourni par Jeremy D. Pustilnik et Geneviève S. Rios Les musées d’histoire naturelle du monde entier détiennent collectivement plus d’un milliard de spécimens dans leurs collections, depuis les peaux d’animaux et les fossiles jusqu’aux plantes pressées, minéraux et objets du patrimoine culturel. Seule une petite fraction de ces objets est exposée au public, tandis que la plupart restent dans des armoires de collection où ils sont étudiés par des scientifiques, mais rarement vus par un public plus large. Pour la plupart des chercheurs souhaitant étudier des spécimens, il est souvent nécessaire de se rendre dans […]
Message fourni par Brooke Bond (Gibbons) Dhufish d’Australie occidentale, Glaucosoma hebraicum, filmé par une vidéo à distance sous-marine appâtée (BRUV). Les écologistes rêvent souvent de grands ensembles de données. La combinaison d’observations issues de plusieurs études dans l’espace et dans le temps pourrait révéler des tendances qui seraient autrement impossibles à détecter. Mais quiconque a tenté de fusionner des ensembles de données provenant de différentes sources sait que la réalité est souvent moins glamour. Mon premier travail consistait à synthétiser des ensembles de données Baited Remote Underwater Video (BRUV) provenant de toute l’Australie. Les systèmes BRUV […]
