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12/04/2023

Notre numéro d’avril est sorti ! – Blog des méthodes


Notre Numéro d’avril est désormais en ligne ! Ce numéro contient 11 articles sur les dernières méthodes en écologie et évolution y compris l’apprentissage automatique, l’extraction de gènes mitochondriaux, les oiseaux robots et bien plus encore !

Articles en vedette

La popularité de l’apprentissage automatique (ML), l’apprentissage en profondeur (DL) et l’intelligence artificielle (IA) ont fortement augmenté ces dernières années. Cet article fournit un aperçu complet du domaine de ML et DL, résumant ses développements historiques, les familles d’algorithmes existantes, les différences avec les outils statistiques traditionnels et pourquoi et quand les modèles ML et DL excellent dans les tâches de prédiction, où ils pourraient offrir des alternatives aux méthodes statistiques traditionnelles. pour l’inférence, mettant en évidence les applications actuelles et émergentes pour les problèmes écologiques.

Cet article décrit un système de bout en bout pour acquérir des données à haute résolution temporelle, les transférer vers un serveur via un réseau Internet des objets à l’aide de technologies à faible coût, et les rendre disponibles avec des visualisations graphiques dynamiques et des capacités de téléchargement. Ce système permet de capter le microclimat dans des environnements contrastés avec une précision comparable aux solutions commerciales, et une grande souplesse dans le traitement des données. Il a le potentiel d’être utilisé par un large public de scientifiques intéressés par la capture de variables environnementales en temps réel et à une fréquence temporelle élevée.

Variables écologiques peuvent être exprimées sur quatre échelles de mesure de base (nominale, ordinale, intervalle ou rapport), tandis que les variables circulaires et celles combinant un état nominal avec d’autres types d’échelles sont également courantes. Les méthodes existantes ne sont pas adaptées pour calculer les corrélations entre toutes les combinaisons par paires de ces variables, empêchant l’application de techniques multivariées standard. L’essence de la nouvelle approche est de dériver une soi-disant semi-matrice de différence pour toutes les paires d’observations pour chaque variable, puis de calculer la corrélation matricielle basée sur deux de ces semi-matrices.

Chanter chez les oiseaux s’accompagne de mouvements du bec, de la tête et de la gorge. Le rôle de ces repères visuels a longtemps été supposé être un facilitateur important dans la communication vocale, y compris les interactions sociales et l’acquisition de chansons, mais a fait l’objet de peu d’études expérimentales. Pour déterminer si les signaux audiovisuels sont pertinents pour le chant des oiseaux, nous avons utilisé l’enregistrement vidéo à grande vitesse, la numérisation 3D, la technologie d’impression 3D et la peinture aux couleurs réalistes pour créer RoboFinch, un robot open source imitant les adultes qui correspond aux propriétés temporelles et chromatiques de la vision des oiseaux chanteurs. .

Le chercheur en couverture

L’image de couverture de ce mois-ci montre un chercheur traquant un animal équipé d’un collier émetteur dans le cadre de la surveillance de la population d’animaux sauvages. Ces activités de surveillance impliquent souvent l’observation du cycle biologique d’animaux individuels afin de déterminer les principaux indicateurs démographiques d’une population, tels que les taux de natalité, de mortalité et de dispersion. Dans la plupart des études sur la faune, cependant, il est courant que des animaux surveillés disparaissent dans des circonstances inexpliquées, ce qui rend difficile de tirer des conclusions fiables sur la mort et la dispersion. Ces personnes disparues sont-elles mortes ou dispersées ? Hodel et al. présentent une méthode qui s’appuie sur des informations sur les événements connus de décès et de dispersion pour reconstituer le sort des personnes disparues. Leur approche offre la possibilité de réduire les biais dans les estimations de la mortalité, ce qui est d’une importance fondamentale pour la recherche sur l’écologie, l’évolution et la conservation. © Dominique Behr





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