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Ce problème Contient les dernières méthodes d’écologie et d’évolution. Lisez pour découvrir les articles en vedette de ce mois-ci et l’article derrière notre couverture!

En vedette

Impact des paramètres de l’indice acoustique sur les comparaisons de paysage sonore

Les indices écoacoustiques sont souvent utilisés pour caractériser les aspects spécifiques de l’environnement acoustique. Pour plusieurs indices couramment utilisés, les impacts des paramètres des paramètres et des régimes d’échantillonnage sur les valeurs de sortie n’ont pas été entièrement explorés, malgré le potentiel de biais. Pour y remédier, les auteurs ont effectué trois analyses de sensibilité sur les paramètres de l’indice acoustique. Les analyses démontrent que la sélection des paramètres seul peut influencer l’amplitude et la direction de la différence entre les sorties d’index acoustique, affectant à son tour l’interprétation comparative. Ces effets dépendent également des données de paysage sonore (par exemple, la fréquence d’échantillonnage, les bandes de fréquence cible). Dans cette étude, les auteurs fournissent un aperçu des moteurs de ces effets et recommandations pour mieux comprendre les implications de la variance de l’indice pour les comparaisons intriques et entre études.

Vantage: une application ouverte pour la visualisation, la navigation et l’analyse des données vidéo et séries temporelles auxiliaires dans les études de bio-blogging

Le déploiement de caméras vidéo transmis aux animaux en plus d’autres journalistes de séries chronologiques est devenue populaire ces dernières années. Ces déploiements génèrent de grandes quantités de données qui ne sont souvent pas synchronisées et peuvent être difficiles à analyser. Ici, les auteurs présentent Vantage (analyse vidéo et outil de navigation pour une exploration graphique avancée), une nouvelle interface utilisateur graphique open source. Vantage vise à simplifier le traitement long des données et les analyses à travers (1) une visualisation simultanée des séquences vidéo et des données de séries chronologiques bio-engageuses qui accompagnent, (2) la synchronisation temporelle des différents flux de données, (3) une annotation efficace entre les types de données, et (4) l’amélioration vidéo et les fonctions d’apprentissage machine.

Eemtoolbox: un package R convitif pour une modélisation d’écosystèmes d’ensemble flexible

La modélisation des écosystèmes d’ensemble (EEM) est une méthode quantitative utilisée pour paramétrer les modèles à partir de caractéristiques écosystèmes théoriques plutôt que de données. Pour faciliter l’utilisation des méthodes EEM, les auteurs introduisent Eemtoolbox, un package R pour calibrer les modèles d’écosystèmes quantitatifs. Le package permet à la génération d’ensembles de paramètres satisfaisant les fonctionnalités de l’écosystème en utilisant l’algorithme d’acceptation-rejet standard ou la nouvelle procédure SMC. Le package étend la méthodologie EEM existante à deux structures de modèle supplémentaires et permet aux utilisateurs de définir leurs propres structures de modèle. Avec son interface simple, EemtoolBox facilite la génération simple des ensembles de paramètres EEM, débloquant ainsi des méthodes statistiques avancées prenant en charge les décisions de conservation à l’aide de modèles de réseau écosystémique.

Un nouvel appareil pour étudier la cognition des poissons dans la nature

Il y a peu d’études de cognition de poisson qui ont été menées sur le terrain ou avec des populations de poissons sauvages. Vila-Pouca et al. Introduisez un nouvel appareil cognitif conçu pour les poissons dans leurs habitats naturels, démontrant son efficacité en effectuant deux tests en utilisant une tâche sociale de recherche de nourriture. Les résultats montrent que cet appareil à faible coût et facile à adapter est efficace pour évaluer une variété de capacités cognitives entre différentes espèces de poissons. Cette étude fournit un point de départ pour tester différents aspects de la cognition des poissons dans des conditions naturelles et peut ouvrir la voie à l’examen de la variation cognitive in situ entre les espèces et les populations exposées à différentes conditions écologiques.

Manuel de protocoles pour les mesures standardisées des traits floraux pour les pollinisateurs dans les communautés tempérées

Les traits floraux décrivent des organes ou des structures directement liés à la reproduction des plantes, et ils sont essentiels pour comprendre les interactions plante-pollinateur, notamment à des fins de conservation. Les auteurs présentent un manuel de 24 protocoles standardisés dédiés aux traits floraux regroupés en trois catégories: (indices visuels et olfactifs, accessibilité et ressources) qui peuvent être appliqués à un large ensemble d’espèces végétales tempérées pour quantifier ces traits à l’échelle des communautés végétales. Ils fournissent également quatre caractéristiques supplémentaires liées à l’abondance des fleurs et à la phénologie qu’ils recommandent de mesurer pour augmenter les valeurs de traits des espèces individuelles aux communautés de plantes globales.

Vers des estimations biologiquement réalistes du domaine vital et de l’exposition spatiale pour les animaux coloniaux

Les auteurs proposent une nouvelle méthode d’estimation du domaine vital (HR) pour les animaux coloniaux qui tient compte des interactions spatialement complexes sans modélisation individuelle (IBM) coûteuse par calcul (IBM). Le modèle d’espace colonie utilise les règles mécanistes suivantes (1) la perméabilité du paysage hétérogène, (2) la compétition dépendant de la densité entre et entre la colonie, (3) les définitions flexibles du chevauchement entre les colonies et (4) l’utilisation d’espace secondaire en raison de la navette. Contrairement aux approches standard de l’industrie, cette méthode ne repose ni sur le suivi exhaustif de toutes les colonies ni sur les IBM à forte intensité informatique. Il peut plutôt prédire les HR des estimations et des emplacements de la taille des colonies et peut être réglé de manière flexible sur les caractéristiques de différentes espèces pour étudier les questions fondamentales et appliquées sur les modèles d’utilisation de l’espace colonial.

Image de couverture

Cette photo montre un freediver installant un hydrophone pour la surveillance acoustique passive (PAM) près de Lizard Island, en Australie, dans le cadre de la Australian Coral Reef Resilience Initiative. Le PAM émerge comme un outil évolutif pour les études environnementales dans les environnements marins et terrestres. Le PAM est souvent soutenu par des indices écoacoustiques, qui sont destinés à résumer les données de paysage sonore et à fournir des informations écologiques utiles. Les indices écoacoustiques, bien que largement utilisés, sont encore une technique relativement nouvelle, et les meilleures pratiques d’utilisation sont toujours en développement. Dans leur article, Kemp et al. Montrez comment la sélection des paramètres peut affecter les sorties d’index en termes absolus et pour les études de PAM comparatives, potentiellement altérant l’interprétation. Il est important de déterminer à quel point une métrique est sensible à une métrique avec un ensemble de données donné pour comprendre la validité écologique des études écoacoustiques. Les auteurs présentent des conseils pour utiliser les analyses de sensibilité dans les travaux futurs.

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