Notre numéro de février est sorti maintenant! – Blog de méthodes

Ce problème Contient les dernières méthodes d’écologie et d’évolution. Lisez pour découvrir les articles en vedette de ce mois-ci et l’article derrière notre couverture!

En vedette

Dix lignes directrices pratiques pour la recherche en microclimat dans les écosystèmes terrestres

Cette revue présente 10 lignes directrices pratiques pour la recherche au sol des microclimats terrestres, couvrant les méthodes et les meilleures pratiques de la conceptualisation initiale de l’étude aux analyses de données. Les directives englobent l’importance des microclimats; les détails de quoi, où, quand et comment les mesurer; la conception d’études en microclimat; et les approches optimales pour analyser et partager des données pour une utilisation et des collaborations futures. L’article est structuré comme un guide chronologique, conduisant le lecteur à travers chaque étape nécessaire pour mener une étude en microclimat complète. Les auteurs discutent également des voies de recherche supplémentaires et du développement dans ce domaine.

Dosage de la comète à œufs à œufs: un protocole pour quantifier les dommages à l’ADN dans les bioarchives naturels

Le test COMET (CA), développé à l’origine comme test de toxicité, quantifie l’intégrité de l’ADN à partir de la distribution d’ADN à travers un champ électrique. Cependant, l’AC n’a jamais été appliqué à des œufs dormants de taxons aquatiques archivés dans les sédiments du lac. Salimraj et al. visait à adapter et à optimiser un protocole CA pour de tels stades dormants en utilisant des œufs de daphnie comme modèle. Leur protocole fournit une méthode rentable pour évaluer les dommages à l’ADN dans les propagules sédimentaires. Plus généralement, il est applicable à tester l’intégrité de l’ADN dans les propagules individuels avant le séquençage du génome ou à quantifier les impacts environnementaux sur les biobanques sédimentaires naturels.

ChirParray: un réseau de microphones à faible coût, facile à construire pour une surveillance écoacoustique à long terme

Cette étude introduit le chirparray, un réseau de microphones rentable et facilement assemblé pour une surveillance écoacoustique à long terme des écosystèmes de plein air. Le système de chirparray dispose d’un réseau de microphones à quatre canaux qui estime les directions de source sonore, aide à identifier les animaux individuels et fournit une analyse comportementale détaillée. ChirParray propose une faible consommation d’énergie, un faible coût et une personnalisation élevée, ce qui le rend idéal pour une surveillance écoacoustique multipoint à long terme avec les avantages des enregistrements multicanaux.

Utiliser des diagrammes causaux et des modèles de superpopulation pour corriger les biais géographiques dans les données de surveillance de la biodiversité

Cette étude combine des diagrammes causaux avec des «modèles de superpopulation» pour corriger les biais géographiques variant dans le temps dans les données de surveillance de la biodiversité. Boyd et al. Supposons qu’une tendance temporelle en moyenne de Y sur tous les sites du paysage pertinent est la quantité cible, et elle est estimée en ajustant des modèles de superpopulation distincts pour chacune de plusieurs périodes temporelles. Ils testent l’approche à l’aide de données simulées, puis les appliquent à des données réelles du schéma de surveillance des papillons britanniques (UKBMS).

L’expérience de l’écosystème Wayqecha Amazon Cloud Curtain: une nouvelle méthode expérimentale pour manipuler les entrées d’eau de brouillard dans les systèmes terrestres

La quantité et la fréquence de l’immersion du brouillard sont affectées par des changements anthropiques en cours rapides, mais les impacts de ces changements restent relativement mal compris par rapport aux changements de précipitations. Ici, les auteurs présentent la conception et les performances d’une nouvelle expérience pour manipuler activement l’abondance de brouillard bas dans une forêt de nuages ​​montagneuse tropicale à l’ancienne au Pérou. Ils présentent les résultats de 2 à 7 ans de surveillance d’une gamme de variables climatiques dans le tracé de traitement d’exclusion de brouillard et un tracé de contrôle non modifié adjacent. Discuter des opportunités et des défis de l’adaptation de l’approche des autres environnements et des conceptions expérimentales.

Image de couverture

L’image de couverture de ce mois dispose d’un orthomosaïque de 72 mètres carrés d’un récif corallien segment automatiquement et classé à l’aide de RapidBenthos. Développé par Remmers et al., Ce flux de travail innovant utilise l’apprentissage automatique pour l’extraction des caractéristiques et les analyses des données photogrammétriques provenant de l’orthomosaïque sous-marine des récifs coralliens. Le flux de travail automatisé intègre le modèle de segment tout (SAM) et l’annotation du point de reefcloud dans un processus en deux étapes: (1) l’emploi d’un modèle de segmentation d’apprentissage automatique open source pré-formé, qui supprime la nécessité pour les utilisateurs de générer manuellement les amendes- Les données de formation segmentées à l’échelle et (2) classifier les segments résultants à l’aide des images d’enquête sous-jacentes à partir de plusieurs points de vue, atteignant la classification à des niveaux taxonomiques plus élevés. Cette étude démontre que les outils d’intelligence artificielle peuvent extraire automatiquement et de manière fiable des données de l’orthomosaïque avec un niveau sans précédent de détails taxonomiques et de précision. Bien que l’approche ait été développée et testée sur des images à partir d’un récif corallien peu profond, il a le potentiel d’être appliqué à tout écosystème surveillé via la photogrammétrie et est évolutif pour les applications à grande surface. Ces progrès permettent la mise à l’échelle durable des techniques de surveillance photogrammétrique, offrant une compréhension plus complète de la composition et de l’habitat communautaires des récifs coralliens. À son tour, cela inspirera de nouvelles questions de recherche, améliorera les modèles d’écosystème et soutiendra une meilleure gestion des écosystèmes.