Mappage 3D sémantique évolutif des récifs coralliens avec apprentissage en profondeur – Blog de méthodes

Tout au long de mars et avril, nous présentons articles présélectionnés pour le prix Robert May 2024. Le Prix ​​Robert May est décerné chaque année par la British Ecology Society pour le meilleur article en méthodes en écologie et en évolution écrite par un auteur en début de carrière. L’article de Jonathan Sauder ‘Cartographie 3D sémantique évolutive des récifs coralliens avec apprentissage en profondeur‘ est l’un de ceux présélectionnés pour le prix.

Le papier

De quoi sert votre article présélectionné et de quoi cherchez-vous à répondre avec vos recherches?

Les récifs coralliens sont en baisse dans le monde, mais en raison de l’évolutivité limitée des méthodes de surveillance des récifs, notre compréhension de la façon dont les récifs sont affectés par les facteurs de stress restent incomplets. Nous capitalisons sur la synergie entre la cartographie 3D basée sur l’apprentissage en profondeur et les réseaux de neurones pour la segmentation sémantique, afin de concevoir une méthode pour traiter automatiquement les transects vidéo de récif coralliens en quelques minutes.

Avez-vous été surpris par quoi que ce soit lorsque vous y travaillez? Avez-vous eu des défis à surmonter?

Le principal défi était de combler l’écart interdisciplinaire – trouver un langage commun pour décrire les méthodes qui sont à la fois technologiquement possibles et trouver de véritables applications écologiques.

Quelle sera la prochaine étape dans ce domaine?

La prochaine étape de ce domaine consiste à faciliter le déploiement de méthodes basées sur l’IA dans de nouvelles régions biogéographiques et à augmenter davantage la résolution et la robustesse.

Quels sont les impacts ou implications plus larges de vos recherches pour la politique ou la pratique?

L’impact plus large de la conception d’une telle méthode de surveillance évolutive et abordable est que la surveillance des récifs coralliens devient réalisable même dans les régions avec des ressources de recherche fortement restreintes, démocratisant la participation à la science des récifs coralliens. En outre, la méthodologie générale peut être appliquée à un large éventail d’autres écosystèmes sous-marins qui sont actuellement coûteux à surveiller.

L’auteur

Comment vous êtes-vous impliqué dans l’écologie?

Mon pivot de l’informatique pure au travail appliqué en écologie s’est produit par hasard – même si j’étais toujours préoccupé par les problèmes environnementaux et écologiques. Face à l’opportunité de cette position de doctorat interdisciplinaire, j’étais impatient d’utiliser mes antécédents de calcul dans des applications écologiques.

Quelle est votre position actuelle?

Actuellement, je suis doctorant à l’école Polytechnique Fédéral de Lausannne (EPFL), co-organisée par le laboratoire de la science informatique et de l’observation de la Terre (ECEO) et le Laboratoire de géochimie biologique.

Avez-vous poursuivi les recherches sur lesquelles votre article concerne?

Oui, nous continuons à travailler à améliorer la méthodologie et à étendre sa portée à plus de régions.

Quel conseil donneriez-vous à quelqu’un dans votre domaine?

Lorsque vous travaillez sur la technologie pour l’écologie ou la conservation, il est facile de se laisser emporter par des gadgets technologiques. J’essaie de faire un effort pour penser aux questions écologiques sous-jacentes et comment nous pouvons améliorer les écologistes dans leur travail, au lieu d’essayer de rivaliser.