Les microbes intestinaux carnivores offrent un aperçu de la santé des écosystèmes sauvages

« Plus précisément, nous avons constaté que la martre sauvage dans des environnements relativement non perturbés avait un régime alimentaire plus carnivore que la martre dans les zones touchées par l’homme », déclare Erin McKenney, co-auteur principal d’un article sur les travaux et professeur adjoint d’écologie appliquée à l’État de Caroline du Nord. Université. La martre est un petit mammifère apparenté à la belette, au furet et au vison.

« En conjonction avec nos autres travaux sur les microbiomes carnivores, cette découverte nous indique que les écosystèmes microbiens dans les intestins des carnivores peuvent varier considérablement, reflétant l’environnement d’un carnivore », déclare McKenney. « Entre autres choses, cela signifie que nous pouvons dire à quel point les humains ont un impact sur une zone en évaluant les microbiomes intestinaux des carnivores qui vivent dans cette zone – ce qui peut être fait en testant les excréments d’animaux sauvages. Concrètement, ces travaux révèlent un outil précieux pour évaluer la santé des écosystèmes sauvages.

« Notre objectif ici était de déterminer comment, le cas échéant, la perturbation humaine d’un paysage affecte le microbiome intestinal de la martre d’Amérique qui vit dans ce paysage », explique Diana Lafferty, co-auteure principale de l’article et professeure adjointe de biologie à Université du nord du Michigan. « Et les réponses ici étaient assez claires. »

Pour l’étude, les chercheurs ont recueilli des données sur le microbiome intestinal de 21 martres. Seize martres ont été récoltées au cours d’une saison de piégeage légale. Les cinq autres ont été piégés en toute sécurité et relâchés au Huron Mountain Club, situé dans la péninsule supérieure du Michigan.

« Le Huron Mountain Club est particulièrement important pour cette étude, car il est relativement vierge – l’une des plus grandes forêts vierges de l’est des États-Unis », a déclaré Lafferty. « Cela en fait une excellente juxtaposition aux 16 martres qui ont été récoltées, puisque celles-ci ont été récoltées dans des régions plus touchées par l’activité humaine. »

Les chercheurs ont découvert que les microbiomes intestinaux de la martre dans la forêt vierge du Huron Mountain Club étaient clairement distincts de la martre récoltée dans d’autres régions.

« Cela reflète le fait que la martre dans une forêt relativement vierge est capable de se nourrir à un niveau trophique plus élevé, ce qui signifie qu’elle occupe une place plus élevée dans le réseau trophique », explique Lafferty. « En d’autres termes, la martre dans la forêt relativement vierge a un régime plus carnivore, alors que la martre dans les zones où il y a plus de gens était plus omnivore. Fondamentalement, les résultats nous indiquent qu’un paysage perturbé entraîne un régime alimentaire significativement différent, ce qui se reflète dans leurs microbiomes intestinaux.

« Il convient également de noter que nous avons pu piéger et relâcher la martre au Huron Mountain Club au cœur de l’hiver, car nous avons conçu et construit des pièges sur mesure pour les protéger des éléments », explique Chris Kailing, co-auteur du papier qui a travaillé sur le projet alors qu’il était à la Northern Michigan University. « C’est intéressant car cela rend possible l’échantillonnage hivernal pour de futures recherches sur la faune, même dans des conditions hivernales difficiles. »

« Il s’agit du dernier chapitre d’un corpus de recherches en cours qui nous aide à comprendre les microbiomes intestinaux des carnivores », déclare McKenney. « Les microbiomes intestinaux des carnivores sont intrinsèquement plus variables que les microbiomes intestinaux des autres animaux. Cette étude apporte une nuance à l’image émergente selon laquelle toute cette variabilité n’est pas seulement du bruit. Au contraire, cette variabilité découle du paysage nutritionnel auquel les carnivores ont accès – et cela, à son tour, reflète la santé de l’écosystème que les carnivores habitent. Et cela signifie que la surveillance du microbiome intestinal des carnivores sauvages peut nous offrir un véritable aperçu des écosystèmes dans lesquels vivent ces carnivores.

Les travaux ont été réalisés avec le soutien de la Huron Mountain Wildlife Foundation.

Source de l’histoire :

Matériaux fourni par Université d’État de Caroline du Nord. Original écrit par Matt Shipman. Remarque : Le contenu peut être modifié pour le style et la longueur.