Du travail de terrain à la modélisation théorique – mon parcours dans la mesure de la biodiversité – Methods Blog

Cela fait quelques semaines depuis le 15e Symposium chinois sur la science et la conservation de la biodiversité, où s’est tenu le premier « Séminaire sur les méthodes en écologie et évolution en Chine ». a eu lieu. Dans ces articles de blog, nous entendons certains des lauréats du « Prix du jeune chercheur exceptionnel en méthodologie écologique et évolutionniste en Chine ». Ici, le gagnant Yi Zou discute de ses recherches.

Message fourni par Yi Zou.

Je suis professeur agrégé au Département des sciences de la santé et de l’environnement à Université Jiaotong de Xi’an-Liverpool. Mes recherches portent principalement sur la façon dont les paysages changeants affectent la diversité des insectes, la pollinisation et les services de lutte biologique contre les ravageurs. Je m’intéresse également à mesurer efficacement la biodiversité dans différentes dimensions à travers des simulations de modèles et des études empiriques.

Mon parcours de recherche a commencé avec mon doctorat en 2010 à l’UCL, où j’ai étudié comment la diversité des insectes évolue selon les gradients environnementaux. J’ai étudié deux groupes mégadivers : les coléoptères terrestres (Coleoptera : Carabidae) et les papillons géométridés (Lepidoptera : Geometridae). Au cours de ce travail, j’ai rapidement réalisé que l’exhaustivité des échantillons était un défi : plus d’espèces ont tendance à être enregistrées à mesure que plus d’individus sont capturés, ce qui rend difficile la comparaison équitable de la biodiversité entre des échantillons incomplets et incohérents.

Bien qu’il existe des méthodes standardisées pour résoudre ce problème pour la diversité alpha (qui mesure la richesse en espèces), la diversité bêta (qui mesure le changement dans la composition des espèces) en tient rarement compte. À l’époque, il existait un logiciel appelé Compah96, conçu pour les systèmes MS DOS, capable de calculer la diversité bêta pour des tailles d’échantillon standardisées à l’aide de certains indices. Cependant, ce logiciel est finalement devenu indisponible.

Plusieurs années après avoir terminé mon doctorat, j’ai revisité ces indices et les ai implémentés dans R. Avec mon directeur de thèse, le professeur Jan Axmacher, nous avons évalué leurs performances et les avons comparés à d’autres indices couramment utilisés, ce qui a conduit à une publication dans Méthodes en écologie et évolution. Par la suite, nous avons développé un nouvel indice qui permet d’estimer le nombre total d’espèces dans un échantillonet le nombre total d’espèces partagées entre deux échantillons provenant de communautés incomplètement échantillonnées.

Nous avons maintenant développé un package R, raretR, qui peut être téléchargé depuis CRAN. Nous pensons que ce package est un outil précieux pour comparer la diversité α et β dans des échantillons incomplets, en particulier pour les taxons très mobiles et riches en espèces comme les insectes.

Je me définis toujours comme un écologiste de terrain. Bien que mener des recherches théoriques soit intellectuellement stimulant, je crois que relier le travail empirique sur le terrain avec des approches théoriques rigoureuses renforce notre compréhension de la biodiversité et du fonctionnement des écosystèmes pour nous aider à mener de meilleures recherches.

Article édité par Lydia Morley