Notre numéro de juin est désormais en ligne ! Ce numéro contient 17 articles sur les dernières méthodes en écologie et évolution, y compris les données scientifiques citoyennes, les drones et les articles multi-auteurs et bien plus encore ! Lisez pour en savoir plus sur les articles vedettes de ce mois-ci et l’article derrière notre couverture.
Articles en vedette
Des chercheurs en écologie et en biologie évolutive dépendent de plus en plus du code informatique pour mener leurs recherches. Par conséquent, l’utilisation de méthodes efficaces pour partager, reproduire et collaborer sur le code ainsi que la recherche de documents est fondamentale. Pour aider les chercheurs en écologie et en évolution à adopter des fonctionnalités utiles de GitHub pour améliorer leurs flux de travail de recherche, cet article passe en revue 12 façons pratiques d’utiliser la plateforme.Alors que de plus en plus d’écologistes et de biologistes de l’évolution établissent leurs flux de travail à l’aide de GitHub, le domaine peut continuer à repousser les limites de recherche collaborative, transparente et ouverte.
Formation informatique pour les sciences écologiques et évolutives est devenue plus abondante et accessible au cours de la dernière décennie, mais le développement d’outils a dépassé la disponibilité de formations spécialisées. Bien que la formation informatique actuelle crée un excellent point de départ, les styles de script linéaires peuvent risquer de devenir laborieux et chronophages et moins reproductibles en nécessitant souvent une exécution manuelle. Un logiciel de gestion des flux de travail (WMS) peut contribuer à la reproductibilité, l’intelligibilité et l’efficacité de calcul des pipelines complexes. Cet article traite des avantages et des défis de la mise en œuvre de WMS à travers une étude de cas avec le package target r pour mettre davantage en évidence les avantages de WMS grâce à l’automatisation du flux de travail, au suivi des dépendances et à une meilleure clarté pour les réviseurs.
Planification de la conservation nécessite de grandes quantités de données, mais la collecte de données est coûteuse et il y a souvent un compromis entre la quantité et la qualité des données qui peuvent être collectées. Les chercheurs se tournent de plus en plus vers les programmes scientifiques communautaires pour répondre à leurs besoins en données sur la biodiversité, mais la fiabilité de ces sources de données est toujours une source de débat courante. Cet article met en évidence quatre solutions principales basées sur la recherche utilisant des données scientifiques communautaires qui peuvent être appliquées à toutes les collectes de données et recherches sur la biodiversité. Il s’agit de garantir que les précieuses données scientifiques communautaires reçoivent la place qu’elles méritent, et que les données collectées par des experts sont correctement vérifiées et les biais pris en compte à l’aide de tous les outils à notre disposition.
La valeur à grande échelle collaborations pour résoudre des problèmes complexes est largement reconnue, mais de nombreux obstacles entravent une paternité significative pour tous sur les publications multi-auteurs qui en résultent. collaboration internationale à long terme de centaines de scientifiques
Estimation de la taille de l’échantillon par l’analyse de puissance est un outil fondamental dans la planification d’une étude écologique, mais il n’existe actuellement aucune procédure bien établie pour déterminer quand les abondances multivariées doivent être collectées. Cet article propose une procédure d’analyse de puissance qui répond à ces trois défis en : utilisant pour la simulation un modèle de copule gaussien avec une structure analytique factorielle démontrée sur des données pilotes d’assemblages de poissons dans une étude de restauration.
Les sceaux sur la couverture
La couverture du mois est d’un éléphant de mer femelle pendant la saison de reproduction. Ils apportent avec eux l’énergie des graisses stockée lors de la recherche de nourriture en mer pour atterrir et l’utiliser pour élever leur progéniture sur les lieux de reproduction – la quantité de graisse corporelle est un indicateur important de la santé des mammifères marins car elle détermine leur succès de reproduction et leur survie individuelle. Cependant, il est difficile d’obtenir des données longitudinales sur l’augmentation et la diminution de la quantité de graisse des mammifères marins, qui passent la majeure partie de leur temps en mer. Dans cette étude, une nouvelle étiquette d’origine animale reliée par satellite a été développée pour surveiller les changements dans la santé des réserves de graisse en temps réel. En traitant à bord des données chronologiques de profondeur et d’accélération pour résoudre une équation biomécanique clé et en envoyant les données par satellite, il a été démontré que le changement de la quantité de graisse (∝ densité corporelle) des phoques migrant vers l’océan pouvait être surveillé en temps réel. pendant sept mois. Ce système basé sur des étiquettes fournit une base méthodologique pour les évaluations de la santé d’un large éventail de mammifères marins, y compris les baleines qui ne s’échouent pas, et aide potentiellement à mieux comprendre la réponse des mammifères marins aux changements de l’environnement marin. © Taiki Adachi.