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Notre numéro de décembre est maintenant disponible ! – Blog des méthodes


Ce numéro contient 19 articles sur les dernières méthodes en écologie et évolution, notamment les drones, la mouillabilité des feuilles et beaucoup plus! Lisez pour découvrir les articles vedettes de ce mois-ci et l’article derrière notre couverture.!

Articles en vedette

Qu’est-ce qui fait une bonne soumission pour Méthodes en écologie et évolution et qu’est-ce qui ne fonctionne vraiment pas ? Les meilleurs articles sur les méthodes, quel que soit le type d’article, concernent la méthodologie elle-même, et non
les résultats de l’étude de cas. Un bon premier indicateur d’un article de recherche qui est réellement une méthode
Le document est que l’introduction identifie une lacune dans les méthodologies existantes qui est indépendante de
un organisme ou un système d’étude. Les nouveaux modèles, méthodes statistiques et indices doivent être testés avec des ensembles de données simulés qui explorent un large éventail d’espaces de paramètres possibles et identifient les taux d’erreur.
Nos types d’articles plus courts – Applications, Outils pratiques – devraient être formulés de la même manière. Ils
doit remplir une niche vide, et non reproduire ou remanier une niche existante. Toute nouvelle méthode devrait
faciliter le travail des chercheurs et des praticiens, mais pour encourager son adoption et son utilisation future, le
Le document devrait clairement comparer la nouvelle méthode avec celles qui sont déjà disponibles et faire en sorte que
le cas pour que quelqu’un change.

Perte de biodiversité a un impact important sur de nombreuses fonctions écosystémiques (FE). Il est urgent de quantifier l’effet de la perte de biodiversité sur les FE. Cette revue résume les modèles mécanistiques couramment appliqués dans les études BEF actuelles et propose un nouveau modèle BEF basé sur les réseaux d’interactions d’espèces.

Utiliser les phylogénies des espèces actuelles pour estimer les trajectoires des taux de diversification (taux de spéciation et d’extinction au fil du temps) est une tâche difficile en raison de problèmes de non-identifiabilité. Cet article présente une nouvelle méthode d’exploration des classes de congruence que nous implémentons dans le package R CRABS. Alors que les méthodes existantes contraignent soit le taux de spéciation, soit la trajectoire du taux d’extinction, la nôtre offre plus de flexibilité en échantillonnant simultanément des trajectoires de spéciation et de taux d’extinction congruentes.

Approches bayésiennes à la modélisation des systèmes écologiques sont de plus en plus populaires, mais il existe des méthodes concurrentes pour les comparaisons formelles de modèles. Les approches basées sur des modèles telles que la chaîne de Markov à sauts réversibles Monte Carlo (RJ-MCMC) sont flexibles et permettent l’inférence multimodèle, mais peuvent être complexes à mettre en œuvre et à optimiser. Nous traduisons donc une approche basée sur des modèles pour les applications écologiques utilisant l’échantillonnage par importance en estimer la vraisemblance marginale des données étant donné un modèle particulier. Cette approche permet la comparaison de modèles grâce à l’estimation des facteurs de Bayes ou des probabilités de modèle postérieures interprétables, produisant des poids de modèle qui facilitent l’inférence multimodèle grâce à la moyenne du modèle bayésien.

On suppose souvent que les caractéristiques de mouillabilité et de drainage des feuilles de différents taxons sont apparues à la suite d’une sélection évolutive, peut-être pour limiter la durée de l’humidité des feuilles, ou pour diriger l’eau efficacement vers le sol et le système racinaire, plutôt que de subir une perte par évaporation. La nouvelle table inclinable utilise des composants largement disponibles (microcontrôleur, moteur pas à pas et pilote, écran à cristaux liquides (LCD) et code de fonctionnement personnalisé) pour obtenir une inclinaison contrôlée sur une plage de 0° à >90° à des taux d’inclinaison contrôlés par l’utilisateur. Il convient à une utilisation sur le terrain, de sorte que les spécimens de feuilles peuvent être testés quelques minutes après leur collecte.

Le papillon sur la couverture

La couverture de ce mois-ci montre Hemaris fuciformis, le papillon des abeilles à larges bordures, en vol : une des espèces enregistrées avec le système buzzOmeter décrite par Volponi et coll. Les pollinisateurs, depuis les abeilles et les guêpes, en passant par les mouches et les papillons de nuit, produisent des bourdonnements ou des bourdonnements en vol. L’enregistrement de ces sons n’est pas une tâche facile et a principalement été réalisé dans des conditions artificielles ou à l’aide d’insectes attachés. Le système buzzOmeter se compose d’un outil simple pour enregistrer les insectes en vol libre dans la nature, d’un tutoriel sur le traitement des fichiers et d’un script R pour l’attribution des enregistrements audio aux espèces correspondantes. Le système peut être appliqué dans diverses études bioacoustiques et d’interactions entre espèces où il est important d’obtenir des enregistrements d’animaux non en détresse dans leur habitat. © Marta Skowron Volponi.





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