Qitong Wang et Huajun Yin, de l’Institut de biologie de Chengdu de l’Académie chinoise des sciences, discutent de leur article : La rhizosphère comme point chaud du dépôt de nécromasse microbienne dans le réservoir de carbone du sol
En matière de stockage du carbone organique du sol (COS), la rhizosphère – une zone de sol autour des racines des plantes – joue un rôle central mais souvent sous-estimé. Les microbes de la rhizosphère sont alimentés par les composés libérés par les racines, ces composés stimulent l’activité microbienne et pilotent les processus clés du cycle du carbone du sol. Parmi ces processus figure la formation de nécromasse microbienne – les restes organiques de micro-organismes morts. Ces résidus microbiens peuvent former un pool stable de carbone, jouant un rôle essentiel dans la séquestration à long terme du COS.
Au cœur de notre compréhension du stockage du COS dans la rhizosphère se trouve le concept de pompe à carbone microbien (MCP) dans le sol, qui explique comment les processus anabolisants microbiens contribuent à la formation de matière organique (MOS) dans le sol. Ce concept remet en question les idées traditionnelles selon lesquelles les intrants d’origine végétale dominent le pool de COS, avec des preuves croissantes selon lesquelles le COS est formé non seulement par les plantes, mais dépend également fortement de l’anabolisme microbien. Cela inspire en outre l’idée selon laquelle la nécromasse microbienne joue un rôle plus prononcé dans l’accumulation de COS par accumulation itérative dans des « points chauds » microbiens, comme la rhizosphère. Naturellement, cela soulève la question : ces points chauds microbiens présentent-ils un MCP plus efficace ?
Pour répondre à cette question, nous avons engagé des discussions approfondies avec le Dr Chao Liang de l’Institut d’écologie appliquée de Shenyang, Académie chinoise des sciences, et avons exploré si les parties de la rhizosphère à croissance microbienne rapide pourraient être particulièrement efficaces dans la construction de la MOS. Les professeurs Ziliang Zhang de l’Université polytechnique du Nord-Ouest, Biao Zhu de l’Université de Pékin et Hans Lambers de l’Université d’Australie occidentale ont contribué à affiner ce plan de recherche. Notre objectif était de comprendre comment ces contributions microbiennes au COS peuvent se déplacer entre la rhizosphère et le sol en vrac afin de fournir des informations essentielles pour prédire la dynamique du COS et éclairer les stratégies de gestion des sols.
À cette fin, nous avons entrepris une étude approfondie sur le terrain dans les forêts de conifères alpines du plateau Qinghai-Tibet. Cette région unique offre un cadre idéal pour étudier les sols car elle présente des niveaux de nutriments et des conditions environnementales variables. Nous avons collecté et analysé des échantillons de la rhizosphère et du sol environnant sur 39 sites, permettant une comparaison directe des contributions microbiennes au COS. En mesurant les niveaux de SOC et de sucres aminés (biomarqueurs spécifiques de la nécromasse microbienne), nous avons révélé que le sol de la rhizosphère accumule effectivement davantage de nécromasse microbienne, ce qui stimule encore le stockage du SOC. Cette accumulation est étroitement liée aux niveaux de nutriments du sol : une plus grande disponibilité des nutriments augmente l’efficacité microbienne, ce qui, à son tour, améliore la formation de COS.
Nos travaux s’appuient et renforcent le cadre MCP, en fournissant des preuves empiriques solides à l’échelle régionale pour montrer comment l’anabolisme microbien de la rhizosphère contribue de manière significative au stockage du COS. Bien que les apports d’origine végétale restent importants, le MCP peut faire passer les microbes de la rhizosphère au rôle de principal contributeur de COS, en particulier dans les points chauds microbiens. Comprendre ces contributions microbiennes est crucial pour relever le défi mondial du changement climatique. Les sols constituent l’un des plus grands réservoirs de carbone sur Terre, et leur capacité à agir comme puits de carbone dépend des métabolismes microbiens et de la dynamique des nutriments qui les soutiennent. À mesure que les pressions environnementales s’intensifient, il sera essentiel d’assurer un anabolisme microbien et une production de nécromasse efficaces pour le stockage du COS.
En intégrant le concept MCP à notre compréhension de la rhizosphère, nos recherches mettent en évidence le rôle critique de la rhizosphère dans le cycle mondial du carbone. La rhizosphère apparaît comme une interface dynamique où les plantes et les microbes interagissent pour sécuriser le carbone dans le sol, la nécromasse microbienne jouant le rôle de pierre angulaire dans la formation et la stabilisation du COS. Alors que le monde évolue avec la hausse des températures et l’évolution des écosystèmes, tirer parti du MCP et comprendre les contributions de la rhizosphère pourrait ouvrir de nouvelles opportunités pour améliorer le stockage du COS. Cette plaque tournante cachée sous nos pieds a le potentiel de façonner des écosystèmes plus résilients et d’atténuer le changement climatique.