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Un guide de l’échantillonnage génétique des œufs d’oiseaux non enregistrés – Blog de méthodes


Tout au long de mars et avril, nous présentons articles présélectionnés pour le prix Robert May 2024. Le Prix ​​Robert May est décerné chaque année par la British Ecology Society pour le meilleur article en méthodes en écologie et en évolution écrite par un auteur en début de carrière. L’article de Fay Morland Y compris la fraction invisible dans des études de population entière: un guide de l’échantillonnage génétique des œufs d’oiseaux non enregistrés«est l’un de ces prévisions présélectionnées pour le prix.

Le papier

De quoi sert votre article présélectionné et de quoi cherchez-vous à répondre avec vos recherches?

Notre papier guide l’échantillonnage génétique des embryons défaillants dans les œufs d’oiseaux non rayés, en se concentrant sur les populations sauvages et les espèces protégées. Nous avons étudié si l’ADN pouvait être récupéré des embryons qui échouent au début du développement – non plus testés. Cet ADN nous a permis d’inclure la «fraction invisible» dans notre étude à long terme. L’analyse des microsatellites a révélé le sexe, la paternité et la consanguinité, faisant la lumière sur la défaillance précoce de l’embryon. Nous fournissons également les meilleures pratiques aux chercheurs appliquant ces méthodes et des informations sur la qualité de l’ADN à partir d’embryons défaillants précoces, mettant en évidence leur potentiel d’études futures.

Avez-vous été surpris par quoi que ce soit lorsque vous y travaillez? Avez-vous eu des défis à surmonter?

Nous avons été surpris par la façon dont nous pouvions bien extraire et analyser l’ADN des embryons défaillants précoces, malgré leur petite taille et leur dégradation. Un défi clé était d’assurer une préservation appropriée des échantillons sur le terrain et d’optimiser l’extraction de l’ADN pour maximiser le rendement. Initialement, nous ne savions pas si ces embryons contenaient suffisamment de matériel génétique viable pour l’analyse des microsatellites, mais nos résultats ont montré qu’ils pouvaient fournir des informations précieuses sur le sexe, la paternité et la consanguinité. Surmonter ces obstacles a mis en évidence le potentiel des embryons défaillants précoces dans les études de population et la génétique de la conservation.

Quelle sera la prochaine étape dans ce domaine?

La prochaine étape avec cette recherche sera de développer ces méthodes de séquençage génomique en aval en aval (WGS), afin d’améliorer notre compréhension des causes de l’échec embryonnaire aux premiers stades du développement dans les populations sauvages. Par exemple, le WGS permettra une estimation de la consanguinité en utilisant des séries d’homozygotie et de l’identification des allèles délétères perturbant le développement embryonnaire.

Quels sont les impacts ou implications plus larges de vos recherches pour la politique ou la pratique?

Nous espérons que ces méthodes seront adoptées par d’autres chercheurs travaillant sur des populations d’oiseaux sauvages et qu’ils aideront à améliorer notre compréhension des causes de l’échec de l’éclosion dans les espèces d’oiseaux menacées. En utilisant ces informations, la pratique de la conservation pourrait être adaptée pour fournir les meilleures chances de récupération pour les populations en difficulté d’oiseaux menacés et menacés.

L’auteur

Comment vous êtes-vous impliqué dans l’écologie?

J’ai étudié pour mon baccalauréat en biologie à l’Université Queen Mary à Londres, tout en étudiant, j’ai toujours été attiré par les cours axés sur l’écologie parce qu’il résonne avec ma façon de penser la science. Mon amour de l’écologie a été cimenté à la suite de quelques expériences inspirantes à l’étranger: une excursion sur le terrain de l’écologie tropicale de premier cycle à Bornéo, et un passage en tant qu’assistant de recherche chez Unam au Yucatan, au Mexique.

Quelle est votre position actuelle?

Je travaille actuellement en tant que chercheur postdoctoral à l’Université d’Otago en Nouvelle-Zélande.

Avez-vous poursuivi les recherches sur lesquelles votre article concerne?

Les groupes de mes superviseurs de doctorat, Nicola Hemmings et Patricia Brekke, les auteurs principaux de cet article, continuent avec cette recherche – restez à l’écoute!

Quel conseil donneriez-vous à quelqu’un dans votre domaine?

En tant que chercheur en début de carrière, j’encourage les étudiants à passer du temps dans le domaine, observant leurs espèces d’étude dans son contexte écologique – j’ai trouvé ces expériences inspirantes à la fois en termes de réflexion sur les questions scientifiques et aussi comme motivation en ces jours de doctorat difficiles!





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