Notre numéro de mai est désormais en ligne ! Ce numéro contient 18 articles sur les dernières méthodes en écologie et évolution, y compris les modèles de distribution des espèces, les mesures de température et bien plus encore ! Lisez pour en savoir plus sur les articles vedettes de ce mois-ci et l’article derrière notre couverture.
Articles en vedette
L’effet d’assurance de la biodiversité– que la diversité stabilise les propriétés globales de l’écosystème – est mécaniquement sous-tendue par la variation des traits inter et intraspécifiques dans les réponses des organismes à l’environnement. Cette variation, appelée diversité des réponses, est donc un déterminant potentiellement critique de la stabilité écologique. Ici, Ross et al. examiner les méthodes de mesure de la diversité des réponses et en tirer un cadre méthodologique pour quantifier la diversité des réponses à partir de données expérimentales et/ou d’observation, qui peuvent être appliquées de manière pratique en laboratoire et sur le terrain à travers une gamme de taxons.
Parmi les nombreux indices de diversité dans la boîte à outils de l’écologiste, les mesures qui peuvent être divisées en termes additifs sont particulièrement utiles car les différentes composantes peuvent être liées à différents processus écologiques façonnant la structure de la communauté. La valeur de la décomposition de la diversité proposée est démontrée par l’analyse des données d’abondance réelle sur les assemblages de plantes échantillonnés dans les prairies pâturées et non pâturées en Toscane (Italie centrale).
Voisin-net est une méthode de reconstruction de réseau largement utilisée qui se rapproche des distances par paires entre les taxons par un réseau phylogénétique circulaire. Nous présentons Lpnet, une variante de Neighbor-net. Nous appliquons d’abord des méthodes standard pour construire un arbre phylogénétique binaire, puis utilisons la programmation linéaire entière pour calculer un ordre circulaire optimal qui s’accorde avec toutes les divisions d’arbre.
Entropie de Keyfitz est une métrique largement utilisée pour quantifier la forme de la courbe de survie des populations, des plantes aux animaux et aux microbes. L’entropie de Keyfitz a été définie à l’origine à l’aide d’un modèle en temps continu, et a depuis été discrétisée pour faciliter son calcul à partir de données démographiques en temps discret. Ici, de Vries et al. montrent que la discrétisation précédemment utilisée de la métrique en temps continu ne préserve pas la relation avec des taux de mortalité croissants, décroissants ou constants. Pour résoudre cet écart, nous proposons une nouvelle formule en temps discret pour l’entropie de Keyfitz pour les histoires de vie classées par âge.
La prédiction des interactions entre les espèces gagne du terrain en tant que moyen de contourner les limitations du volume de données. Pourtant, les réseaux écologiques sont difficiles à prévoir car ils sont généralement petits et clairsemés. À l’aide d’arguments mathématiques simples et d’expériences numériques dans lesquelles une variété de classificateurs sont formés sur des réseaux simulés, Poisot développe une série de lignes directrices liées au choix des mesures à utiliser pour la sélection du modèle et aux façons d’assembler l’ensemble de données de formation.
Le poisson sur la couverture
La photo de couverture de ce mois-ci représente un petit gobie des récifs coralliens – Pleusosicya mossambica – reposant sur un corail bulle dans la mer Rouge, en Arabie saoudite. Comme d’autres poissons cryptobenthiques, ce petit animal (Leur article montre que FARMS peut attirer une suite représentative localement d’espèces de poissons cryptobenthiques qui est comparable à d’autres méthodes d’échantillonnage basées sur la zone échantillonnée. Ainsi, FARMS fournit une technique complémentaire utile pour documenter et surveiller les plus petits poissons de récif, en particulier dans les endroits où d’autres méthodes d’échantillonnage sont rendues impossibles en raison de la turbidité élevée, de la profondeur ou des restrictions sur l’utilisation de produits chimiques. © Tane Sinclair-Taylor.