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En vedette
Écologie empirique pour soutenir la modélisation mécaniste: différents objectifs, meilleures approches et avantages uniques
Rendre les modèles mécanistes crédibles nécessite des études empiriques, mais des sujets et des conceptions d’étude traditionnels ne les soutiennent souvent pas bien. Les modèles que nous utilisons pour les problèmes modernes nécessitent des études empiriques qui permettent de comprendre l’histoire de la vie et l’autecologie des espèces d’étude, identifient les modèles généraux utiles pour la conception et l’évaluation du modèle, collecter des données de types que les modèles montrent sont importants et développent des sous-modèles et de la théorie pour les mécanismes au niveau individuel. Les écologistes peuvent mieux produire de telles connaissances via la recherche qui: (a) est interdisciplinaire et de niveau de niveau, souvent conçu pour comprendre juste assez sur les individus pour soutenir des modèles individuels de populations et de communautés; (b) est conçu pour quantifier les relations entre les gammes larges, au lieu de tester les hypothèses statistiques; c) met l’accent sur la pertinence et le réalisme sur la précision; et (d) comprend des conditions stressantes pertinentes pour les défis de gestion modernes.
Algorithmes de particules pour la modélisation des mouvements animaux dans les récepteurs
Les filtres à particules et les lisses sont des algorithmes séquentiels de Monte Carlo utilisés pour s’adapter aux modèles non linéaires et non gaussiens. Ces algorithmes sont bien placés pour adapter des modèles axés sur le processus aux données de suivi des animaux, en particulier dans les récepteurs, mais à ce jour, ils ont reçu une attention limitée dans la littérature écologique. Lavender et al. introduit un algorithme de filtrage bayésien qui reconstruit les mouvements individuels et les modèles d’utilisation de l’espace à partir de données de suivi des animaux, en mettant l’accent sur les systèmes de télémétrie acoustique passive. Cette étude établit une nouvelle pointe pour la modélisation des mouvements dans les récepteurs. Les algorithmes de particules fournissent un cadre de modélisation robuste, flexible et intuitif avec des applications potentielles dans de nombreux contextes écologiques.
Patteau: algorithmes de particules pour le suivi des animaux dans R et Julia
L’ajustement des modèles d’espace d’état aux données de suivi des animaux peut être difficile et coûteux en calcul. Ici, Lavender et al. Introduisez Patter, un package qui fournit des algorithmes de filtrage et de lissage des particules qui s’adaptent aux modèles d’espace d’état bayésien pour suivre les données, en mettant l’accent sur les données des animaux aquatiques dans les récepteurs. Dans deux exemples, les auteurs montrent comment mettre en œuvre le Patter pour reconstruire les mouvements d’un animal étiqueté dans un système de télémétrie acoustique à partir de détections acoustiques et d’observations auxiliaires. Le PTATL facilite les analyses robustes, flexibles et efficaces des données de suivi des animaux. Les méthodes sont largement applicables et permettent des analyses raffinées de l’utilisation de l’espace, des gammes domestiques et de la résidence.
L’imagerie de microscope benthique sous-marine PAM (bosse): un outil non invasif pour l’évaluation in situ de la microstructure et de l’efficacité photosynthétique
Essentiel à la vie sur Terre, la photosynthèse marine est d’une importance capitale. La photosynthèse se produit dans les entités microscopiques spatialement discrètes à différents niveaux d’organisation biologique. La cartographie de l’efficacité photosynthétique in situ sur des échelles appropriées est très prometteuse pour en savoir plus sur ces processus. Pour atteindre cet objectif, Ben-Zvi et al. Conçu, fabriqué et testé un microscope sous-marin qui intègre la couleur standard, l’épiorescence et l’imagerie d’afluorescence de chlorophylle variable avec une résolution spatiale presque micron qui résout la structure et l’efficacité photosynthétique des organismes benthiques. Le système d’imagerie permet la recherche jamais possible sur la santé et la physiologie des organismes aquatiques benthiques in situ, le plaçant dans le contexte de leur environnement physique et biologique.
Vers une approche unifiée de la modélisation de l’adaptation entre les démographes et les écologistes évolutifs
Les approches de modélisation démographique et évolutive sont essentielles pour comprendre et projeter les réponses des espèces aux changements environnementaux mondiaux. Ici, les auteurs développent un nouveau modèle de population matricielle de la matrice d’Evodemo (MPM des hyper-hyper) qui intègre l’héritage génétique des traits quantitatifs, permettant un calcul rapide de la dynamique évolutive et démographique. Ils évaluent le MPM des hyper-hyper d’Evodemo contre les simulations individuelles et fournissent des approximations analytiques pour les taux d’adaptation sur six échelles distinctes en réponse à la sélection. Leurs résultats démontrent que le MPM d’évodemo-hyper fournit des solutions précises et efficaces en calcul, correspondant étroitement à des résultats à partir de simulations individuelles et d’approximations analytiques dans des conditions biologiques similaires.
Image de couverture
La couverture de ce mois présente un lémur à queue à chariot (Chat de lémurien) Produire un appel de contact aux conspécifiques à proximité. De telles vocalisations portent des informations clés, y compris l’identité de l’appelant – un élément essentiel dans de nombreuses études sur la communication animale.
L’analyse acoustique automatisée, y compris l’apprentissage automatique, est de plus en plus utilisée dans l’étude de la communication animale, mais la diversité des méthodes utilisées à travers les études a rendu difficile les comparaisons entre espèces. Dans leur article, Wierucka et al. Évaluez systématiquement diverses techniques d’extraction et de classification des caractéristiques utilisées pour déterminer l’identité de l’appelant dans les vocalisations, à travers 16 ensembles de données de mammifères. Ils montrent que l’utilisation de coefficients cepstraux de fréquence MEL ou de classificateurs de forêts aléatoires donne une précision d’identification plus cohérente de l’appelant, indépendamment de la taille des espèces ou de l’échantillon. En identifiant des approches robustes et standardisées, ce travail jette les bases d’une recherche plus comparable et reproductible en bioacoustique, faisant progresser notre compréhension de l’évolution de la communication vocale des mammifères.
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